ゲノム機能分野 Division of Genomics
研究業績
1. 論文
LincRNA-p21 exon 1 expression correlates with Cdkn1a expression in vivo. Furuhata R, Imasaka M, Sugimoto M, Yoshinobu K, Araki M, Araki K. Genes Cells. 2022 Jan;27(1):14-24.
Gene trapping reveals a new transcriptionally active genome element: The chromosome-specific clustered trap region. Takeda I, Araki M, Ishiguro KI, Ohga T, Takada K, Yamaguchi Y, Hashimoto K, Kai T, Nakagata N, Imasaka M, Yoshinobu K, Araki K. Genes to Cells. 2021 Aug 21.
The lncRNA Caren antagonizes heart failure by inactivating DNA damage response and activating mitochondrial biogenesis. Sato M, Kadomatsu T, Miyata K, Warren JS, Tian Z, Zhu S, Horiguchi H, Makaju A, Bakhtina A, Morinaga J, Sugizaki T, Hirashima K, Yoshinobu K, Imasaka M, Araki M, Komohara Y, Wakayama T, Nakagawa S, Franklin S, Node K, Araki K, Oike Y. Nat Commun. 2021 May 5;12(1):2529.
＊トラップクローンAyu21-T167でトラップした新規lncRNAの機能が明らかになりました＊
Tamoxifen feeding method is suitable for efficient conditional knockout. Yoshinobu K, Araki M, Morita A, Araki M, Kokuba S, Nakagata N, Araki K. Exp Anim. 2021 Feb 6;70(1):91-100.
＊Cre組換え誘導において摂餌によるタモキシフェン投与の有効性を示しました＊
Endometrial cancer with a POLE mutation progresses frequently through the type I pathway despite its high-grade endometrioid morphology: a cohort study at a single institution in Japan. Monsur M, Yamaguchi M, Tashiro H, Yoshinobu K, Saito F, Erdenebaatar C, Li C, Iwagoi Y, Ohba T, Iyama KI, Katabuchi H. Med Mol Morphol. 2021 Jan;54(2):133-145.
＊日本人におけるPOLE変異子宮内膜癌のPOLE変異の抽出に携わりました＊
精巣上体の発生・分化：遺伝子改変マウスを用いたアプローチ. 奥野知世, 石坂駿行, 川畑遊星, 竹田直樹, 吉信公美子, 荒木喜美, 吉永和也. 熊本大学医学部保健学科紀要第16号(2020).
＊Lgr4トラップマウス解析に参加しました＊
Mammalian NSUN2 introduces 5-methylcytidines into mitochondrial tRNAs. Shinoda S, Kitagawa S, Nakagawa S, Wei FY, Tomizawa K, Araki K, Araki M, Suzuki T, Suzuki T. Nucleic Acids Res. 2019 Sep 19;47(16):8734-8745.
WDR11-mediated Hedgehog signalling defects underlie a new ciliopathy related to Kallmann syndrome.
Kim YJ, Osborn DP, Lee JY, Araki M, Araki K, Mohun T, Känsäkoski J, Brandstack N, Kim HT, Miralles F, Kim CH, Brown NA, Kim HG, Martinez-Barbera JP, Ataliotis P, Raivio T, Layman LC, Kim SH. EMBO Rep. 2018 Feb;19(2):269-289.
Development of an efficient screening system to identify novel bone metabolism-related genes using the exchangeable gene trap mutagenesis mouse models. Kurogi S, Sekimoto T, Funamoto T, Ota T, Nakamura S, Nagai T, Nakahara M, Yoshinobu K, Araki K, Araki M, Chosa E. Sci Rep. 2017 Jan 20;7:40692.
Database for exchangeable gene trap clones: pathway and gene ontology analysis of exchangeable gene trap clone mouse lines. Araki M, Nakahara M, Muta M, Itou M, Yanai C, Yamazoe F, Miyake M, Morita A, Araki M, Okamoto Y, Nakagata N, Yoshinobu K, Yamamura K, Araki K. Dev Growth Differ. 2014 Feb;56(2):161-74.
＊EGTCクローンの総まとめ！＊
2. 学会発表
2022年度
microRNA-142の機能獲得型変異による白血病発症メカニズムの解析
○河野慎吾、荒木喜美、指田吾郎、荒木正健
第81回日本癌学会学術総会（パシフィコ横浜）2022年10月1日ポスター発表
潜性(劣性)遺伝形式で多血症の症状を示す自然発生突然変異マウス『pocy』の解析
◯北元優梨, 増田 好美, 古閑成美, 吉信公美子, 中潟直己, 鳥越大輔, 中村直子, 柳久美子, 要匡, 髙岡裕, 荒木喜美, 荒木正健
日本遺伝学会第94回大会（札幌） 2022年9月14日Web発表
KRAB-ZFPs クラスターはマウス亜種間ハイブリッド ES 細胞の樹立効率と転移因子発現に影響する
◯平山愛理, 徳安碧, 吉信公美子, 荒木正健, 荒木喜美
日本遺伝学会第94回大会（札幌） 2022年9月14日発表
マウスゲノムの転写活性領域 CSCT の機能解析
◯吉信公美子, 川下真奈, 瓜生怜華, 平山愛理, 野田大地, 荒木正健, 荒木喜美
日本遺伝学会第94回大会（札幌） 2022年9月14日発表
マウスゲノムにおいて外来遺伝子発現に適した新たな Safe Harbor の探索と置換システムの構築
◯徳安碧, 古畑理樹, 吉信公美子, 荒木正健, 荒木喜美
日本遺伝学会第94回大会（札幌） 2022年9月15日発表
マウスゲノムにおいて遺伝子は無いのに遺伝子トラップクローンが集積している領域（TCAA）の機能解析
◯荒木 正健, 池田 琉那, 齋藤 桂花, 久場 兼裕, 北元 優梨, 吉信公美子, 山根 万里子, 丹羽 仁史, 荒木 喜美
日本遺伝学会第94回大会（札幌） 2022年9月15日発表
グルタル酸血症２型のモデルマウス作製及び病態解析
◯大平恵里花, 上戸佳那, 吉信公美子, 尾池雄一, 松本志郎, 中村公俊, 荒木喜美, 荒木正健
日本遺伝学会第94回大会（札幌） 2022年9月15日発表
2021年度
潜性（劣性）遺伝形式で多血症の症状を示す自然発生突然変異マウス『pocy』の解析
○北元優梨, 増田好美, 古閑成美, 吉信公美子,中潟直己, 鳥越大輔, 中村直子, 柳久美子, 要匡, 髙岡裕, 荒木喜美, 荒木正健
日本遺伝学会第93回大会（オンライン開催）2021年9月9日発表
ゲノム編集を用いた2-3MbにもわたるKRAB-ZNFクラスター領域の欠損アレルの作製
○荒木喜美, 吉信公美子, 荒木正健
日本ゲノム編集学会第6回大会（オンライン開催） 2021年6月17日発表
潜性（劣性）遺伝形式を示す自然発生多血症モデルマウス『pocy』の解析
○増田好美, 北元優梨, 吉信公美子,中潟直己, 鳥越大輔, 中村直子, 柳久美子, 要匡, 荒木喜美, 荒木正健
日本ゲノム編集学会第6回大会（オンライン開催） 2021年6月17日発表
2020年度
CSCT：マウスゲノムの機能領域としての可能性
○吉信 公美子, 橋本 紘一, 甲斐 拓篤, 荒木 喜美, 荒木 正健
第43回日本分子生物学会年会（オンライン開催） 2020年12月2日発表
染色体特異的にクラスターを形成しているトラップ領域（CSCT4）の解析
○橋本 紘一、武田 伊世、甲斐 拓篤、吉信 公美子、荒木 喜美、荒木 正健
日本遺伝学会第92回大会、2020年9月16日〜18日、熊本市くまもと県民交流館パレア（新型コロナウイルス感染拡大のため紙上開催）
急性骨髄性白血病由来の遺伝子変異を導入したマウスの表現型解析
○河野 慎吾、Rachael A Nimmo、指田 吾郎、Jie Bai、吉信 公美子、荒木 喜美、荒木 正健
日本遺伝学会第92回大会、2020年9月16日〜18日、熊本市くまもと県民交流館パレア（新型コロナウイルス感染拡大のため紙上開催）
マウスゲノムにおいて遺伝子は無いのに遺伝子トラップクローンが集積している領域（TCAA）の解析
○荒木 正健、斎藤 桂花、久場 兼裕、吉信 公美子、山根 万里子、丹羽 仁史、荒木 喜美
日本遺伝学会第92回大会、2020年9月16日〜18日、熊本市くまもと県民交流館パレア（新型コロナウイルス感染拡大のため紙上開催）
APC/C活性化因子FZR1のリン酸化による減数第二分裂移行の制御
○丹野 修宏、國仲 慎治、藤村 幸代子、竹本 一政、岡村 佳保、竹田 直樹、荒木 喜美、荒木 正健、佐谷 秀行、石黒 啓一郎
日本遺伝学会第92回大会、2020年9月16日〜18日、熊本市くまもと県民交流館パレア（新型コロナウイルス感染拡大のため紙上開催）
可変型遺伝子トラップ法を用いた骨軟骨代謝に影響を及ぼす新規遺伝子群の網羅的機能解析
○永井 琢哉、関本 朝久、山口洋一郎、黒木 修司、船元 太郎、今坂 舞、吉信 公美子、荒木 喜美、荒木 正健、帖佐 悦男
日本遺伝学会第92回大会、2020年9月16日〜18日、熊本市くまもと県民交流館パレア（新型コロナウイルス感染拡大のため紙上開催）
グルタル酸血症２型のモデルマウス作製及び病態解析
○中島 東吾、大平 恵里花、吉信 公美子、尾池 雄一、松本 志郎、中村 公俊、荒木 喜美、荒木 正健日本遺伝学会第92回大会、2020年9月16日〜18日、熊本市くまもと県民交流館パレア（新型コロナウイルス感染拡大のため紙上開催）
潜性（劣性）遺伝形式で多血症の症状を示す自然発生突然変異マウス[pocy]の解析
○北元 優梨、増田 好美、古閑 成美、吉信 公美子、中潟 直己、鳥越 大輔、中村 直子、柳 久美子、要 匡、高岡 裕、荒木 喜美、荒木 正健
日本遺伝学会第92回大会、2020年9月16日〜18日、熊本市くまもと県民交流館パレア（新型コロナウイルス感染拡大のため紙上開催）
○染色体特異的にクラスターを形成しているトラップ領域（CSCT13）の解析
甲斐 拓篤、武田 伊世、橋本 紘一、吉信 公美子、荒木 喜美、荒木 正健
日本遺伝学会第92回大会、2020年9月16日〜18日、熊本市くまもと県民交流館パレア（新型コロナウイルス感染拡大のため紙上開催）
Etfb遺伝子トラップマウスを利用したグルタル酸血症２型の病態解析
○大平 恵里花、中島 東吾、吉信 公美子、尾池 雄一、松本 志郎、中村 公俊、荒木 喜美、荒木 正健日本遺伝学会第92回大会、2020年9月16日〜18日、熊本市くまもと県民交流館パレア（新型コロナウイルス感染拡大のため紙上開催）
変異型ヒトWDR11遺伝子のノックインによるカルマン症候群モデルマウスの樹立と解析
○近藤 正啓、河野 慎吾、吉信 公美子、Kim Soo-Hyun、荒木 正健、荒木 喜美
日本遺伝学会第92回大会、2020年9月16日〜18日、熊本市くまもと県民交流館パレア（新型コロナウイルス感染拡大のため紙上開催）
骨表現型スクリーニングで選別したTmem161a欠損トラップマウスは細胞ストレス応答に関与し骨量増加を呈する
○永井 琢哉、関本 朝久、山口 洋一朗、黒木 修司、田島 卓也、谷口 昇、今坂 舞、吉信 公美子、荒木 喜美、荒木 正健、帖佐 悦男
第35回日本整形外科学会基礎学術集会、2020年10月15-16日、Web開催
可変型遺伝子トラップ法で作製したItpr1遺伝子欠損マウスは著名な骨量減少を呈する
○山口 洋一朗、関本 朝久、永井 琢哉、黒木 修司、田島 卓也、谷口 昇、今坂 舞、吉信 公美子、荒木 喜美、荒木 正健、帖佐 悦男
第35回日本整形外科学会基礎学術集会、2020年10月15-16日、Web開催
ゲノム編集を用いた2〜3 MbにもわたるKRAB-ZFPクラスター領域の欠損アレルの作製
○荒木 喜美、吉信 公美子、山口 友輔、高田 幸基、橋本 紘一、荒木 正健
第67回日本実験動物学会総会、2020年5月23日〜25日、大阪市大阪府立国際会議場（新型コロナウイルス感染拡大のため紙上開催）